Clarissa Erica
Les données issues du séquençage de l'ARN à cellule unique peuvent révéler la variété moléculaire des différents types de cellules. Les publications récentes d'atlas de types de cellules pour la moelle épinière de souris n'ont pas encore été combinées. Ici, en utilisant des données de transcriptome à cellule unique, nous créons un atlas des types de cellules spinales, combinant les différents ensembles de données dans un seul cadre de référence. Nous présentons un cadre hiérarchique des interactions entre les types de cellules postnatales, la localisation servant de niveau d'organisation le plus élevé, suivie du statut des neurotransmetteurs, de la famille et de dizaines de populations raffinées. Nous cartographions les distributions géographiques de chaque type de cellule neuronale dans la moelle épinière adulte et validons un code marqueur combinatoire pour chacune. Nous démontrons également des liens de lignée complexes entre plusieurs types de cellules postnatales. Pour aider à la standardisation de l'identification des types de cellules, nous créons également le classificateur de types de cellules open source SeqSeek. Une compréhension intégrée des différents types de cellules spinales, de leur disposition moléculaire et de leurs profils d'expression génétique est fournie par ce travail.